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德国，葛城博士按照雷哲的吩咐找上明日香的母亲，惣流.恭子.齐柏林，她是eva计划德国分部的科学家，其身份和碇唯类似，都是当时的主要负责人，只不过两人的结局都比较相似，同样是成为驾驶员，试验正在开发中的eva，最后在试验中都发生意外，不过碇唯是和初号机融合，而惣流.恭子.齐柏林则被救出来，不过出来后的情况实在不怎么样。
当明日香4岁时，参加了的贰号机的连结实验。虽然她从这次实验存活下来，但是却发疯了，她将明日香的娃娃当作是自己的女儿，而拒绝承认明日香才是自己的女儿。惣流.恭子.齐柏林最后上吊自杀身亡，当时明日香正想将自己获选为驾驶员的好消息告诉母亲，并因此发现她的尸体。
在惣流.恭子.齐柏林自杀后，她的父亲再度与一位德国医生结婚。
她的继母立刻面对到她的防卫心理，而且无法被她所喜爱，当明日香向碇真嗣提及继母时，她并不会说她讨厌继母，但是她也不会让继母取代她真正母亲。
在惣流.恭子.齐柏林的丧礼期间，明日香的祖母向她说她是一位‘坚强的女孩’，但是她可以尽管哭泣。
然而明日香不同意这个提议，并且对祖母说从现在开始她必须照顾自己。
从这一天开始，她向自己约定：她不会再哭了。
这导致她压抑了一个处理感情的良好方式，并且不提及由她母亲的疾病与死亡所导致的心理创伤，导致她在系列故事的后段是脆弱与扭曲的。
其实早在很久前，惣流.恭子.齐柏林就与碇唯，还有葛城博士有联系，因为三人研究的东西都是相同的，所以难免会见面，而在2000年，惣流.恭子.齐柏林也是葛城南极团队的一员，不过她和碇唯一样在第二次冲击之前离开南极，最终逃过一劫。
怎么说呢，其实在雷哲看来明日香和碇真嗣的遭遇很像，目睹自己母亲的实验过程，两人很难说清谁更幸运一些，碇真嗣失去自己的母亲，甚至最后离开父亲，而明日香虽然还有母亲，但对方却因为精神为题没有把她当作女儿，虽然她的父亲和继母对她都很好，可是因为生母的关系，她无法去接受这些东西。
在性格上，她和碇真嗣也成鲜明对比。
明日香与其他的互动是高傲且强势的，而且对于她的外表与担任驾驶员这件事都会相当显著的提及。
然而她在其他人面前的形象是为了掩饰她是一位非常脆弱及没有安全感的女孩，这从她所作的梦或思想来表现出来。
明日香常会激烈而且强制影响其他人的空间，特别是碇真嗣。
她有强烈的需求让自己感到傲慢，而且很不擅长去处理自己的失败，她在中学班上最要好的朋友是班长洞木光，似乎也是她唯一的好友。
虽然洞木光与同班同学铃原冬二经常吵架，不过明日香也给她追求铃原的建议。